日本顺天堂医院在日本医院界中综合排名第一。它在瓣膜疾病、呼吸内科与呼吸外科疾病、肺癌等疾病的治疗方面，水平都是日本顶级的，其中接待肺癌患者人数在全日本排名第一。
1.早期肺癌治愈率95%
顺天堂的呼吸外科凭借着高超的肺癌手术技术，被世界熟知。
在做肺部治疗时，为保证尽量不破坏患者的肺组织，积极地引入微创手术。同时，术中还尽可能减少患者的肺功能损伤。正是由于有了这些措施，使该院早期肺癌术后的5年存活率达到了95%。
术中出血量及围手术期并发症发生率仅为其他医疗发达国家发生率的1/5，凭此实绩该科室在世界胸外科领域受到了瞩目和认可。
2.“更温柔的治愈患者”
2015年独立建科的消化器低侵袭外科，一直秉承“更温柔的治愈患者”的外科精神为患者提供低侵袭治疗。
低侵袭治疗的理念就是：重视根治疾病的同时，让患者早日回归正常生活。
经过不断努力，低侵袭治疗不论在胃癌、食道胃接合部癌等的上部消化道的恶性疾病中，还是在胃粘膜下肿瘤、十二指肠肿瘤、食道裂孔疝、返流性食道炎等上消化道良性疾病的诊疗中，均逐步地得到世界的公认。
3.食道癌手术数量日本第一
顺天堂医院的食道・胃外科也处于世界顶尖水平。由于食道癌手术技术高超，2002年科室调整时，医院将食道·胃外科独立出来，令其专门对食道癌进行诊断、研究和治疗。
2009年由梶山美明担任主任教授后，更加专注于食道和胃疾病的研究，以高质量的淋巴结清除手术确保患者的高生存率，逐渐登上世界领先地位，每年进行的食道癌手术总量位居日本第一。
4. 儿童疑难重症治疗实绩超10000例
顺天堂医院的儿童外科，是在日本率先开展儿童内视镜手术的儿童外科科室。目前，已接收在其他医院难以治疗的疑难重症儿童患者超过10000例，凭此实绩，顺天堂的儿童外科在日本儿童外科领域独占鳌头。